Bioinfo_M2_Pharmaco

La bioinformatique est un domaine interdisciplinaire qui combine la biologie, l'informatique, les statistiques et les technologies de l'information pour analyser et interpréter les données biologiques. Elle implique le développement et l'application de méthodes et d'outils informatiques pour acquérir, stocker, organiser et analyser de grands ensembles de données biologiques, tels que des séquences d'ADN, des structures de protéines, des profils d'expression génique, et plus encore.

La bioinformatique joue un rôle crucial dans de nombreux domaines de la recherche biologique et a des applications en génomique, protéomique, biologie structurale, biologie évolutive, découverte de médicaments et médecine personnalisée, entre autres.


Epidemiologie

Master : Microbiologie/ Semestre 3/  UE Découverte

Intitulé de la matière : Epidémiologie/ Crédits :2/Coefficients : 2
Enseignante responsable de la matière : Dr Eddaikra Atika (cours et TD)

 

Objectifs de l’enseignement

 A la fin de ce cours, l’apprenant sera capable de :

  1. Acquérir des connaissances méthodologiques dans le domaine de l’épidémiologie en santé publique et en recherche clinique.
  2. Analyser des données cliniques émanant d’enquêtes épidémiologique lier à microbiologie et infectiologie et Interpréter des articles scientifiques traitant de ces sujets
  3. Maitriser les Notions d’analyses et d’interprétation des données en biostatistique

 Conditions et connaissances préalables

Prérequis recommandées : l’étudiant est censé avoir acquis en L1 et L2 , les notions de mathématique , probabilité et statistique comme compétences après le succès à cette matière.

 Programme 

Chapitre 1 : Introduction Epidémiologie

1.1 Généralités Les domaines de l’épidémiologie

1.2. L’épidémiologie descriptive

1.3. L’épidémiologie analytique

 

Chapitre 2 : Facteurs de risque

2.1. Déterminant Risque Facteur étiologique

2.2. Déterminant Facteurs de risque Quelques définitions

 

Chapitre 3 : Mesures en Epidémiologie

3.1. Généralités sur les outils de mesure en épidémiologie

3.2. La morbidité La mortalité Mesures d’association

 

Chapitre 4 : Notion de sondage

4.1. Tirage au sort

4.2. Généralités Tirage au sort

Chapitre 5 : Biais - Causalité Les biais Causalité

Chapitre 6 : Epidémiologie analytique

6.1. Schémas d’étude Enquête transversale

6.2. Enquête de cohorte

6.3. Enquête cas-témoins

 

Le travail personnel sera fait sur la base d’articles de recherche ou d’enquête Cas-témoins et des rapports.

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à l’appréciation de l’équipe de formation) Continu (interrogation) + Examen



Immunité anti-infectieuse, immunothérapie

Dans les conditions de santé, les pathogènes sont incapables de pénétrer dans l’organisme. Ceci est dû au fait que notre organisme possède des
barrières naturelles comme la peau, les muqueuses, la barrière intestinale. En revanche, dans le cas où ces barrières sont lésées comme une blessure,
brulure,…etc, le pathogène pénètre dans l’organisme et entraine des dégâts. Cette situation est interpréter par notre organisme comme un danger. En effet,
notre organisme est alerté constamment des dangers potentiels pour notre organisme par un système que l’on appelle système immunitaire

 Contenu de la matière
-Physiologie immunitaire dans les défenses anti-infectieuses
–Tolérance systémique et muqueuse 
– Au niveau tissulaire : concept d’immunités locales 
– Au niveau cellulaire : concepts de coopérations et de migrations cellulaires 
– Au niveau moléculaire : concepts de coopérations et d’interactions 
– Intégration des méthodes immunologiques dans les techniques utilisées en immunodiagnostic 
– Approfondissement des mécanismes physiopathologiques mis en jeu dans les inflammations chroniques, les maladies
auto-immunes, et les déficits immunitaires acquis
Le travail personnel se fera sur la base des études
de bases moléculaires, cellulaires et physiologiques des
immunothérapies et biothérapies (anticorps monoclonaux, vaccinations) proposées en cancérologie, allergologie
et maladies auto-immunes

Intoxications et pathologies liées à l'eau

Le cours intitulé « Intoxications et pathologies liées à l’eau » permet d’identifier les différentes ressources en eau et leurs types de polluants. Il explique également le rôle de l'eau en tant que réservoir et/ou vecteur des microorganismes et des contaminants chimiques. Public cible : 1ère année Master, spécialité Microbiologie.


Intoxications et pathologies liées à l’eau

Législation copie 10

L’objectif du cours est de rendre l'étudiant en biologie capable de lire un texte de loi et d'appliquer une réglementation régissant les manipulations dans le domaine de la biologie ainsi connaitre l'éthique dans l'expérimentation animale ,connaitre aussi les réglementations liées aux produits chimiques utilisés au laboratoires.
L'étudiant est appelé aussi à étudier : les organismes de santé (OMS, Centers for Disease Control and Prevention (CDC)),  les organismes de normalisation et accréditation (IANOR, ALGERAC) et ceux chargés de contrôle (DCP, CACQUE, bureau d’hygienne, ONML) ainsi de connaitre les normes internationales (ISO, codex alimentarius, NA, AFNOR).
 

 


Maitrise de la securité aux laboratoires

Ce module s'articule sur les chapitres suivants:

1. Règles générales de sécurité à suivre dans les laboratoires de microbiologie

2. Règles de manipulation des produits chimiques (Etiquetage et phrase de risques et phrases de sécurité) 

3. Risques biologiques (milieu biologique, ADN, organismes génétiquement manipulés …) 

4. Collecte et élimination des déchets biologiques et chimiques 

Techniques de Base de la Biologie Molécuailre

Objectif: présenter les méthodes incontournables en laboratoire de recherche

L'Acide désoxyribonucléique (ADN) principalement ainsi que l'acide ribonucléique (ARN) chez certains virus sont les supports de l’information génétique.
Les Techniques d’études de ces macromolécules sont primordiales pour comprendre l’organisation et la dynamique des génomes mais aussi la fonction des gènes et les mécanismes moléculaires et cellulaires.